Председатель Правительства Михаил Мишустин подписал распоряжение от 19 мая 2020 г. № 1323-р о назначении Дениса Ушакова заместителем руководителя Федерального агентства морского и речного транспорта.

Ранее Денис Ушаков работал начальником Управления безопасности судоходства Росморречфлота, осуществляя полномочия в области обеспечения безопасности судоходства в акватории Северного морского пути, в акваториях морских портов Российской Федерации, на подходах к ним и на внутренних водных путях Российской Федерации.